Uygulamalı Biyoinformatiğe Giriş ve R programlama dilinde veri bilimi uygulamaları

17-18-19 Aralık 2021
Cuma 20:00-22:00,
Cumartesi Pazar 11:00 – 17:00

Biyoinformatik ve R programlama dili yaşam bilimleri alanında çalışan her araştırmacının mutlaka uyguladığı yöntemler içeren, araştırmaların verimini arttıran ve yeni araştırmalar için ufuk açan bir alanlar.

Bu eğitim biyoinformatik alanında yeni olanlar için tasarlanmış kapsayıcı ve hızlı bir başlangıç sunar. Biyoinformatiğin ne olduğu, tarihi gelişimi, önemli projeleri ele alarak başlayan bu uygulamalı eğitim, BLAST, çoklu ve ikili hizalama çalışmaları, biyolojik veri tabanları ve filogenetik uglamalarla biyoinformatiğe meraklı olanlara hızlı ve uygulamalı bir başlangıç sunuyor. DNA dizileme teknikleri ve genom projelerini inceledikten sonra R programlama dilinde uygulamalı veri çalışmalarıyla tecrübe sağlıyor.

Kazanımlar

Biyoinformatiğin temelleri, veri tabanları, BLAST, hizalama ve filogenetik çalışmaları uygulamalı olarak işlenir. R programlama dilinin temelleri, Tidyverse, ggplot2, veri manipülasyonu, grafik çizdirme ve görselleştirme uygulamaları işlenir. Hem teorik hem de pratik olarak konularda kazanımlar sağlanır.

Kimler Katılabilir

Temel olarak yaşam bilimleri eğitimi alanlar ve biyoinformatiğe ilgi duyanlar katılabilir. Katılmak için bilgisayarınız ve internet erişiminiz olması yeterlidir.

R’da başlangıç seviyesinde olanlar için uygundur.

Eğitmen

MSc. RAVZA GÜR

Marmara Üniversitesi Biyomühendislik (İngilizce) bölümünden 2016 yılında onur öğrencisi olarak mezun olmuştur. Lisans tezinde, biyoinformatik yaklaşımlar kullanarak var olan onaylanmış ilaçların yeniden amaçlandırılması üzerine çalışmıştır.

Yüksek lisansını 2018 yılında Yıldız Teknik Üniversitesi‘nde tamamlamıştır ve insan metabolik yolaklarının çizgi teorisi algoritmasını kullanarak analiz edilmesi üzerine çalışmıştır.

2019 yılından beri doktora eğitimine Oxford Üniversitesi‘nde Biyoinformatik alanında devam etmektedir. Çalışma konuları; biyolojik problemler için analitik metotlar geliştirme, yoğun olarak tek hücreli ATAC sekans verisi (single cell ATAC sequencing) olmak üzere yeni nesil dizileme analizi ve makine öğrenmesidir.

Katılım Belgesi

Eğitimden sonra tüm katılımcılara QR kodlu ve doğrulanabilir dijital katılım belgeleri hedef.im platformu üzerinden sağlanacaktır.

Katılımcılarımız eğitimden sonra alacakları QR kodlu dijital katılım belgelerini LinkedIn gibi sosyal ağlara kolayca ekleyebilir ve çeşitli platformlarda kolayca paylaşabilirler.

Eğitimde işlenecek konular

  • Biyoinformatik nedir?
  • Biyoinformatik nasıl ortaya çıktı? 
  • Biyoinformatiğin önemi
  • Biyoinformatiğin uygulama alanları 
  • Biyoinformatikçinin özellikleri nedir?
  • Biyolojik veri tabanları genel tanıtımı
  • Nükleotit sekans veri tabanları
  • Protein sekans veritabanları
  • Pathway veritabanları
  • Hastalık arama veritabanları
  • Mikroarray/RNA sekans verilerine nasıl erişebiliriz?
  • Biyolojik veritabanlarında sorgulama – uygulamalı 
  • NCBI veritabanında DNA dizisi sorgulama – uygulamalı 
  • Uniprot veritabanında protein dizisi sorgulama – uygulamalı 
  • Insan Genom projesi
  • Omik veriler
  • HapMap projesi
  • DNA dizilemenin tarihçesi
  • Dünden günümüze DNA sekanslama metodları
  • Zincir sonlandırma yöntemleri
  • Maxam-Gilbert sekanslama
  • Sanger dizileme
  • Büyük ölçekli sekanslama
  • Yeni nesil dizileme (Next Generation Sequencing)
  • R programlama diline giriş
  • Harici R kütüphaneleriyle nasıl çalışırız? 
  • R’da veri bilimi uygulaması için ‘Tidyverse’ R paketinin yüklenmesi
  • R’da veri görselleştirilmesi için ‘ggplot2’ R paketinin yüklenmesi
  • R programlama dilinde dosya okuma ve yazma işlemleri
  • R’da veri manipülasyonu
  • R’da grafik tipleri
  • R’da grafik çizme
  • R’da ggplot2 kütüphanesini kullanarak grafik çizme
  • R’da veri bilimi ve görselleştirme uygulamaları

Tarih: 17-18-19 Aralık 2021
Toplam: 12 saat

17 Aralık Cuma:
20.00 – 22.00

18 Aralık Cumartesi:
11.00 – 13.00 | 14.00 – 17.00

19 Aralık Pazar:
11.00 – 13.00 | 14.00 – 17.00

Eğitim Ücreti
425,00 TL + %18 KDV’dir.

Taksit imkanı bulunmaktadır. Havale ya da EFT yapmak isteyenler info@eresbiotech.com adresinden iletişime bizimle geçebilirler.

Eğitim Google Class üzerinden sürdürülecek ve dersler kaydedilecektir. Ders kayıtları daha sonra katılımcıların erişimine açık olacaktır.

ÖNEMLİ NOT: Eğitim programı, kayıtların 15 kişiye ulaşmaması durumunda ertelenecek ve 15 kişi tamamlandığında açılacaktır.